Последипломная и специализированная подготовка моряков осуществляется в Центре подготовки и аттестации плавсостава - специально созданном в 1999 году структурном подразделении университета. Ежегодно на его курсах проходят обучение более 5 тыс. моряков. Курсы подготовки моряков - по безопасности судовождения, радиоспециалисты, повыешние квалификации комнадного состава судов. Обучение судоводителей, судомехаников, навигаторов.
